Eu recebi a seguinte mensagem ao executar o build de um Web Setup ou tentar fazer um Publish do meu projeto:

Unable to build project output group ‘Content Files from {yourProject} (Active)’

Onde {yourProject} é o nome do meu projeto.

No meu caso, o erro foi corrigido verificando se os arquivos relacionados no projeto estavam fisicamente nas pastas do adequadas. O primeiro passo, para corrigir esse erro é clicar em ‘Show All Files’ e procurar pasta por pasta por arquivos marcados com o ícone de alerta.